Всегда все упиралось в регулярное выражение в командной строке, по умолчанию доступны самые простые типа
ls abc.***
или ls [A-Z]*.txt
Дак вот чтоб выбрать несколько файлов, для начала надо включить расширенный синтаксис в shell
$ shopt -s extglob
ну а уже после - например создать архив из 3х дирикторий
$ tar -czvf arch.tgz ($DIR_NAME_1|$FILE_NAME_1|$DIR_NAME3)
особо талантливые могут включить extglob в bashrc и т.п.
ссылка на более детальный мануал(с примерами)